由正科到二級主任科員是不是降職了

算。二級主任科員是正科級，屬於非領導職務，所以職責略低於科長、鄉長、鎮長等領導職務的正科級領導職務，所以可以算作是降職了。二級主任科員轉任正科實職，是屬於正常的職務提升，必須走選拔任用程序，最高也只能晉升到一級主任科員。