什麼是蛋白質二級結構
二級結構以往是由生物巨分子在原子量級結構下的氫鍵來定義的。那麼什麼是蛋白質二級結構?
1、二級結構在生物化學及結構生物學中,是指一個生物巨分子,如蛋白質及核酸(DNA或RNA),局部區段的三維通式。它並不描述任何特定的原子位置,而這會在三級結構中處理。
2、在蛋白質,二級結構則是以主鏈中氨基之間的氫鍵模式來定義,亦即DSSP所定義的氫鍵,並不包括主鏈與旁鏈間或是旁鏈之間的氫鍵。而核酸的二級結構是以鹼基之間的氫鍵來定義。在很多RNA分子,二級結構對RNA正常功能非常重要,有時甚至於較序列重要。這可以幫助用於分析非編碼RNA。RNA二級結構可以用電腦來提升預測準確性。而其他生物信息學的應用會使用一些二級結構的概念來分析RNA。
3、蛋白質的二級結構包含局部殘基之間由氫鍵所調節的相互作用。最普遍的二級結構就是α-螺旋及β-摺疊,此外還有β-轉角和無規捲曲。經計算後發現其他螺旋,例如310螺旋及π螺旋,在能量上有着有利的氫鍵模式,但這些螺旋卻是在自然的蛋白質中是很稀有的,要α螺旋在中央進行不利的骨架包裝後,才可在末端中發現。緊的轉角、鬆開及靈活的環會連結更多“規則的”二級結構。任意形並非真正的二級結構,但卻是一類缺乏規則的二級結構的形態。
關於什麼是蛋白質二級結構的內容就到這了。
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